В январе 2020 года заболеванию COVID-19 были присвоены коды U07.1/U07.2 в международном классификаторе болезней МКБ-10. Важно заметить, что данные коды являются временными и используются для новых заболеваний НЕЯСНОЙ этиологии или в чрезвычайных ситуациях. В связи с тем, что этиология COVID-19 всё ещё остаётся неизученной, в Рубрикаторе Клинических Рекомендаций Минздрава РФ к данному заболеванию отсутствуют клинические рекомендации по диагностике, лечению и профилактике. Врачи в РФ вынуждены пользоваться лишь временными методическими рекомендациями, которые не приводят к желаемому снижению количества осложнений и летальности пациентов. Возникает справедливый вопрос - если причина заболевания всё ещё не изучена, как могли секвенировать геном вируса, создать к нему пцр-тесты и взять на вооружение генетический код спайк-белка вируса? На этот вопрос популярно отвечает китайский учёный в видео-ролике ℹ29.01.2020г Генеральное консульство РФ в Гуанчжоу (Китай) сообщило следующее: «После первых выявленных случаев заражения в декабре 2019 года китайские ученые в короткие сроки упорядочили вирусный геном и обнародовали его на платформе GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data). Теперь специалисты по всему миру изучают генетическую последовательность нового коронавируса, чтобы понять как бороться с болезнью.» Эта новость радостно разлетелась по всему миру. Учёные вооружились опубликованной буквенной последовательностью генома предполагаемого возбудителя новой пневмонии и принялись разрабатывать пцр-тесты, а также всевозможные генные препараты, которые учат организм самостоятельно синтезировать спайк-белок вируса. Справка Физико-химическое изучение любого вируса, начинается с разработки метода его выделения и очистки. Исходный материал может представлять собой культуральную жидкость, тканевый экстракт и т.д. Во всех этих случаях вирус находится в смеси с большим количеством разнообразных балластных веществ – белков, пигментов, структурных компонентов клеток и прочих загрязнений. Без удаления этих примесей невозможно проводить дальнейшие исследования вирусов. Высокоочищенные вирусы можно получить только благодаря применению целого ряда методов. Идеальным методом является тот, который обеспечивает сохранение биологической активности вирусов при полном разрушении и удалении клеточных компонентов и мембран. Однако, такого метода не существует. «Основы молекулярной биологии вирусов и антивирусной терапии» Зинченко А.И., Паруль Д.А. – 2005г. «Новый коронавирус, связанный с респираторными заболеваниями человека в Китае» 03.02.2020г Была опубликована научная работа китайских учёных, в которой они подробно описали процедуру секвенирования генома нового вируса, который возможно связан с COVID-19. Кратко о проделанной работе: Учёные изучили ОДНОГО пациента, который был госпитализирован в Центральную больницу Уханя 26 декабря 2019 года с тяжелым респираторным синдромом, который включал лихорадку, головокружение и кашель. Чтобы исследовать возможные этиологические агенты, связанные с этим случаем заболевания, учёные собрали жидкость бронхоальвеолярного лаважа (BALF) и исключили наличие в образце BALF вируса гриппа, Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae и других распространенных респираторных патогенов, включая аденовирусы человека. Из 200 мкл BALF была извлечена ОБЩАЯ мета-РНК образца, которая включала РНК-последовательности всех микроорганизмов, находящихся в данном образце, начиная от вирусов до простейших, так и фрагменты собственного РНК пациента (рибосомальные и экзосомальные). Из полученных РНК- фрагментов была создана мета-транскриптомная библиотека с помощью набора SMARTer Stranded Total RNA-Seq v. 2 (TAKARA- умный набор для определения общего количества РНК). С помощью компьютерной программы Megahit (сверхбыстрое одноузловое программное обеспечение для сборки больших и сложных метагеномов с помощью сжатого графика де Брюйна) из полученной мета-транскриптомной библиотеки были выбраны ТОЛЬКО те нуклеотидные последовательности, которые совпали с РНК последовательностями потенциальных этиологических агентов, уже имеющихся в банке данных GenBank. Из выбранных программой сконструированных последовательностей в работу была принята только самая длинная РНК-цепь (30 474 нуклеотидов), так как она на 89,1% была идентична ранее секвенированному в Китае геному коронавируса летучих мышей SARS. Остальные 50.5 миллионов РНК-последовательностей, а также ДНК фрагменты, которые содержались в исследуемом образце BALF в данной научной работе не изучались. Возможность того, что новая атипичная пневмония вызывается ДНК-вирусами, бактериями, грибами или простейшими, которые не входят в список известных распространённых респираторных патогенов, в данной работе не рассматривалась. После того, как из всего многообразия мета-транскриптомной библиотеки удалось собрать рнк-последовательность, которая на 89,1% соответствовала ранее секвенированному геному коронавируса летучих мышей SARS, штамм вируса был обозначен как "2019-nCoV", и всей его последовательности генома (29 903) был присвоен регистрационный номер MN908947 в GenBank. 10.01.2020г Китай опубликовал данные секвенирования на сайте GISAID и официально передал их ВОЗ для последующего создания тест-систем и вакцинных препаратов по всему миру. Таким образом, в данной работе учёные, вместо выделения и очистки, виртуально сконструировали новый вирус 2019-nCoV из обнаруженных РНК-фрагментов с помощью компьютерной программы Megahit. Китай не предоставлял ВОЗ образец очищенного вируса для его дальнейшего изучения. Кроме того, в данной работе не проводились необходимые процедуры для установления этиологической связи между секвенированным геномом вируса и новой атипичной пневмонией:

✖Выделение и очищение инфекционного агента

✖Заражение здорового организма выделенным инфекционным агентом, с последующим получением характерной симптоматики.

✖Изоляция инфекционного агента от искусственно заражённого организма с последующим подтверждением его идентичности с исходным агентом. Без соблюдения вышеперечисленных условий невозможно доказать связь между потенциальным этиологическим агентом и инфекционным заболеванием, а также невозможно изучить морфологию и патогенез инфекционного агента, что крайне необходимо для разработки методов профилактики и лечения инфекционного заболевания.

РЕЗЮМЕ: В

SARS-CoV-2 не был изолирован в чистом виде китайскими учёными, а его этиологическая связь с новой атипичной пневмонией COVID-19 не была достоверно доказана.

http://www.xinhuanet.com/english/2020-01/24/c_138730012.htm

https://www.nature.com/articles/s41586-020-2008-3